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VMD是一个用于Linux操作系统的分子运动绘图分析和模拟软件。我们可以通过免费版的VMD对分子运动图进行分析处理,可以快速模拟运动场景,让你快速了解分子运动的全过程。
软件介绍
Vlinux版是一款面向linux操作系统的分子运动绘制和分析仿真软件。它可以真实地模拟和分析运动场景,提供可视化的图形界面,帮助用户更好地理解和分析变化,提高研究效率,并且操作简单,方便快捷,非常好用。VMD旨在模拟、可视化和分析生物大分子(如蛋白质、核酸等)。).它可以读取和显示PDB文件,提供各种分析方法,可视化选择和渲染,还可以处理和分析分子动力学(MD)模拟的轨迹。
VMD的使用说明
VMD(可变模态分解)是一种自适应的、完全非递归的模态变化和信号处理方法。这种技术的优点是确定模态分解的次数,其适应性在于根据实际情况确定给定序列的模态分解次数。在后续的搜索和求解过程中,能够自适应匹配各模态的最佳中心频率和有限带宽,能够实现本征模态分量(IMF)的有效分离,信号的频域划分,进而得到给定信号的有效分解分量,最终得到变分问题的最优解。
它克服了EMD方法中端点效应和模态分量混叠的问题,具有更坚实的数学理论基础。它可以降低复杂度高、非线性强的时间序列的非平稳性,分解得到相对稳定的不同频率尺度的子序列,适用于非平稳序列。VMD的核心思想是构造和解决变分问题。