潘懋元教授出生于广东东部沿海毗邻福建厦门的汕头市，自幼聪明好学，博览群书，爱好文学。曾在汕头时中中学（四中）、海滨中学（侨中）就读，参加青抗会革命活动，其后毕业于厦门大学教育系并留校任教。新中国成立后，由厦门大学推荐，赴中国人民大学进修研究生课程，学习教育专业。1952年初，因为院系调整，该项进修计划从中国人民大学转到了北京师范大学，从而成为北京师范大学众多优秀校友中的一位杰出代表。
潘懋元教授历任厦门大学高等教育科学研究所名誉所长、学术期刊《海外华文教育》顾问、中国高等教育学会副会长、全国高等教育学研究会理事长、济南大学高等教育研究院名誉院长。曾获国家优秀教学成果奖一等奖、二等奖，获评“全国教书育人楷模”“改革开放30年中国教育风云人物”“中国杰出人文社会科学家”“当代教育名家”“福建省杰出人民教师”等荣誉称号，多次获得全国普通高校人文社会科学研究优秀成果奖一等奖，被中国高等教育学会授予“高等教育科学研究特别贡献奖”。
2000 年，以厦门大学高教所为依托而发展成立的厦门大学高等教育发展研究中心脱颖而出，率先获批成为全国高等教育领域唯一的国家级研究中心 —— 普通高等学校人文社会科学重点研究基地；2004 年以该所为基础，建立了厦门大学教育研究院，该院目前拥有中国高等教育研究领域唯一的国家“985 工程”创新基地。
潘懋元教授带领博士生行走江河，在行走中学习，挥斥方遒；在学术研究中激扬文字，为高等教育学理论的完善殚精竭虑；为人、为师、为学，影响着学界，更是推动了我国高等教育的研究和发展。潘懋元一生勤勤恳恳，躬耕在教学第一线，为探索人才培养模式而不遗余力。山川岁月近百年，“人不下鞍，马不停蹄”正是先生真实的人生写照。
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